花咲蕾是一個(gè)熱愛(ài)花卉、非常了解花卉知識(shí)的初二學(xué)生。某天，隨著父母搬家來(lái)到“希望花市”的途中，花咲蕾做了一個(gè)奇怪的夢(mèng)，夢(mèng)中的她站在一棵名為“心之大樹(shù)”的樹(shù)前，看著光之美少女與暗之美少女戰(zhàn)斗并被打倒，而大樹(shù)上的花朵瞬間全都枯萎了，此時(shí)有只妖精從樹(shù)中竄出，蕾也從夢(mèng)中驚醒了。不料某天放學(xué)后，夢(mèng)中出現(xiàn)的妖精竟然出現(xiàn)在她的眼前，并希望花小蕾可以成為傳說(shuō)中的戰(zhàn)士“光之美少女”，來(lái)幫忙打倒敵人，讓人類之心的源頭“心之大樹(shù)”可以再恢復(fù)到之前繁花盛開(kāi)的模樣，并讓大家的“心之花”綻放而戰(zhàn)。但蕾猶豫了。就在此時(shí)，不明的敵人出現(xiàn)了，并將魔爪伸向了同班好友來(lái)海繪里香。為了拯救好友，花咲蕾?zèng)Q定要成為光之美少女。之后，好友來(lái)海繪里香、學(xué)生會(huì)長(zhǎng)明堂院樹(shù)以及曾將的光之美少女月影百合紛紛加入進(jìn)來(lái)，和蕾一起成為了光之美少女，為拯救“心之大樹(shù)”，粉碎沙漠使徒征服世界的野心而戰(zhàn)斗。